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  科室亞專科設置較齊全，梯隊合理。目前設置了小兒呼吸、消化、神經與遺傳代謝、心血管、腎病風濕免疫、血液、內分泌、重癥與急診、感染、學生兒童結核、學生兒童保健、護理學等11個臨床亞專科，對各亞專科慢病、特殊病實行規范、專科化、全病程、團隊管理模式。

  診療技術較齊全。可常年開展兒童纖維支氣管鏡（灌洗、刷檢、活檢、球囊擴張、冷凍、注藥治療等）、小兒消化內鏡、肺功能、FeNO檢測、持續血液凈化、中心靜脈置管、側腦室引流術、淋巴結穿刺活檢、視頻腦電監測、動態血壓監測、營養管理、徒手鼻空腸置管、全自動骨齡檢測、生長激素激發試驗及兒童危重癥綜合管理等眾多全年齡階段覆蓋的專科診療技術，以及B超引導下鹽水灌腸治療小兒腸套疊等特色技術。同時充分發揮大型三甲綜合性醫院的優勢，聯合神外、普外、胸外、骨科、泌尿外科、放射科、藥劑科等多學科開展圍手術期合作及腦脊液引流術、腦室硬膜下血腫外引流、腦脊液腦室腹腔分流術、腹內壓監測術等多項技術，對特別危重、疑難、難治性兒童疾病進行卓有成效的救治。

  此外，兒童保健部開設了生長發育評估、矮小癥、性早熟、孤獨癥、多動癥等特色專科門診，并通過信息化手段對此類疾病實行全病程、規范化團隊管理。

  長沙市中心醫院兒科在市級醫院中率先開設學生兒童感染科，擁有獨立的醫療護理單元與專業團隊。在兒童感染性疾病如手足口病、流感、新冠、細菌性痢疾、百日咳、傷寒等診治方面具有豐富的經驗。

  學生兒童結核科“脫胎”于我院近100年結核病專科診療中心（肺科醫院，即長沙市結核病研究所），是我院特色中的特色。本專科不僅是湖南省唯一學生兒童結核專科，也是全國少有的幾家兒童結核專科病房之一，設兒童結核重癥病區（ICU），在全國率先獲得兒童結核病營養管理示范病房與專科稱號。技術力量雄厚，已形成全國先進的專業、規范的全病程兒科團隊管理模式。臨床業務水平省內領先，全國先進，部分技術全國領先。常年吸引大量來自全國各地的疑難、難治、重癥、耐藥性兒童結核患者前來就診，同時為所在轄區學生兒童結核防控提供有力支撐。目前年收治病人量達600-800人次，長期位居全國前列。常年開展18歲以下（含新生兒）電子支氣管鏡下灌洗+注藥、鉗夾和球囊擴張術、經皮肺穿刺活檢術、肺動脈介入栓塞止血術、關節腔穿刺注藥、胸腹腔閉式引流術、胸腔鏡、心包閉式引流術、側腦室引流術、淋巴結穿刺活檢、血液凈化、營養管理、深靜脈置管、徒手鼻空腸置管等眾多全年齡階段覆蓋的先進專科診療技術。此外，還常年開展多學科診療模式，聯合神外、普外、胸外、骨科、泌尿外科、藥劑科等多學科對特別危重、疑難、難治性兒童結核病進行卓有成效的救治。